深圳首次发现BF.15变异株,它是如何被命名的?

在此之前,全球范围内尚无关于BF.15的公开报道。

8月30日,深圳,居民排队进行核酸检测。图源:视觉中国

记者 | 刘子象

8月29日,深圳市卫健委相关官员在疫情防控新闻发布会上表示该市首次发现奥密克戎BF.15变异株,是隐匿性和传播力更强的奥密克戎BA.5进化分支。

深圳市疾控中心对8月23日以来的所有病例进行了病毒基因组序列比对分析后发现——大多数个案感染毒株为BF.15变异株(BA.5.2.1的子分支),为深圳本地首次发现;另外部分个案感染毒株为BA.5.2、BA.5.2.1和BA.2.2变异株。上述个案感染毒株与境外报告的部分毒株序列高度同源,不排除个案由境外输入引发本地感染的可能。

相对于其他主流变异株BF.15对公众来说比较陌生界面新闻记者查询发现在此之前全球范围内尚无关于BF.15的公开报道,不过在世卫组织最近的每周流行病学报告提到BF.7变异株

该报告称,87-13日的一周内,其他奥密克戎后代谱系(例如BF.7,别名BA.5.2.1.7)占全部病例的14%,较前一周增长3%这些谱系采用Pango命名方法

根据其官网信息Pango命名方法基于系统发育结构,能清楚表示出突变株在进化上位置以及和其他突变株的亲缘关系的远近。在此规则下名称由大写的字母前缀和数字后缀构成其间用点隔开拉丁字母表中的任何字母都可以单独或组合放在前缀内使用(I、O和X除外)。德尔塔在Pango命名规则下叫做B.1.617.2,奥密克戎叫B.1.1.529

第一英文字母代表变异株属于哪一个支系,后面的数字则代表支系和子代支系的编号,每个表示“的后代”。例如世系B.1.1.7是世系B.1.1的第七个命名后代,而B.1.1又是世系B.1的第一个命名后代。

不过为了避免谱系标签过长,数字后缀最多有三个层次主后缀、次后缀和第三后缀。第三个后缀的后代使用字母表中下一个字母前缀充当父血统名称的别名。例如,血统B.1.1.1的第一个后代不命名为B.1.1.1.1,而是命名为C.1,因此前缀C作为B.1.1.1的别名。

根据规则每个别名的详细信息应在当前谱系描述列表中提供,以便所有Pango谱系的祖先关系可以明确地重建。例如世卫组织在报告中提及BF.7紧随其后标注了“别名BA.5.2.1.7

香港大学病毒学家金冬雁对界面新闻表示,深圳发现的BF.15变异株仍属于BA.5,是其一个“小的亚分支”无需过分担忧新冠病毒一直在持续变化奥密克戎变体传染性增强但是整体致病性降低即便是BA.4/BA.5BA.1/BA.2等姐妹谱系之间的差别也只在一两个氨基酸他说

负责收治患者的深圳第三人民医院院长卢洪洲在接受香港媒体采访时表示BF.15属于BA.5.2.1的子分支与香港卫生署在7月份上传的一株病毒序列高度同源不排除感染源或来自香港然而BF.15在世界范围内鲜有发现其病毒学和临床特征有待进一步研究

深圳疾控中心病原生物研究所所长张仁利在接受深圳官方政务新媒体采访时透露,目前从生物安全实验室的分析结果来看,分离病毒可能要花一两个月的时间,需要较长时间的观察才能明确这种奥密克戎BA.5进化分支对人体细胞的破坏作用。

不过国外一些学者指出BA.5的发展符合致病性增加的趋势829哈佛大学医学院教授William A. Haseltine福布斯杂志上撰文,BA.5比早前的 BA.1/BA.2致病性更严重。

他援引日本科学家Tamura等人最近的一项研究称通过体外气道模拟发现,B.1.1和BA.5呼吸道上皮和内皮屏障的破坏明显高于BA.1或BA.2这表明后变异的BA.5比BA.1或BA.2具有更显著的呼吸影响。

其次通过动物模型观察发现感染BA.5的仓鼠的皮下氧饱和度低于感染BA.1和BA.2的仓鼠这表明与早期的奥密克戎变体相比BA.5的致病性更严重。

最后BA.2和BA.5感染的受试者支气管细胞中的N蛋白浓度较高,更高的N蛋白浓度往往意味着更严重的症状BA.5似乎比BA.1或BA.2更容易致病,尤其是在肺部。

William A. Haseltine得出结论称如果新冠病毒继续进化,新出现的毒株(如BA.2.75和BA.4.6)将遵循类似的致病性增加趋势。

不过在金冬雁看来这个研究的不足之处在于它只是基于动物模型因此其可信度打了折扣

另外哈佛大学的William A. Haseltine提醒考虑到其致病性可能更高,BA.5病例需要更先进的干预措施,如单克隆抗体治疗和抗病毒药物,必须改善此类产品的生产和价格,以满足未来几周和几个月内不断增长的需求。

BA.5目前正在全球占据主导地位世界卫生组织最新数据8月15-21日的一周内,全球病例与前一周相比下降了9%,死亡人数下降15%。BA.5占全球数据库测序病例的74%,高于一周前的71%。总体而言,奥密克戎谱系变体占过去30天内全球报告病例的99%。

来源:界面新闻

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